No Futsal, modalidade com uma história ainda recente no panorama desportivo nacional, anteriormente designado de Futebol de 5, os Atómicos apresentam já um palmarés digno de referência, com títulos em escalões nacionais e distritais e uma presença na 1ª divisão nacional.

Actualmente com 46 atletas, distribuídos pelos escalões seniores, infantis e juvenis, o clube está apostado na formação dos seus atletas, preparando um crescimento sustentado de equipas e atletas para os próximos anos.

Relativamente aos últimos resultados desportivos, a época de 2007/2008 ficou marcada pela subida da equipa sénior à 1ª Divisão Distrital, acompanhada do título de Campeão de Série. Na temporada seguinte, em 2008/2009, a equipa senior garantiu a permanência na 1ª Divisão Distrital. 

Principais Marcos:

1992/93 – Campeão Distrital

1993/94 – Campeão Série 2ª Divisão Nacional

1994/95 – Participação na 1ª Divisão Nacional2